柏林自由大学自建校之初就建立了密切的国际联系。这种国际往来在柏林墙倒塌之前的较封闭的日子发挥了重要的作用。如今这一传统仍然在继续。每年约有2000名来自世界各地的教授到此讲学。同时，柏林自由大学还与北京大学等近150所世界各地的大学签订了协议，进行教师和学生的互换交流。为推广中国文化与语言，柏林自由大学与北京大学合作开办了德国第一所孔子学院，并将于2006年考试招生。

校长迪特·蓝森先生表示，他希望通过建设孔子学院，使柏林自由大学成为德国研究东亚问题的中心，希望教育德国的青年一代，与中国各阶层人士进行广泛的交流，促进两国人民之间的相互了解。

在中国的合作伙伴：

北京大学(1981)、南京大学(1999)、复旦大学(2001)、中山大学(2004)、香港中文大学(2005)、兰州大学(2005)、上海交通大学(2008)、南京农业大学(2008)、同济大学、武汉大学、中国人民大学、暨南大学、国家留学基金委（CSC）、中国科学院南京地理与湖泊研究中心、上海社会科学院